台湾土鸡业者培育出特有杂交优势鸡种，大略可分为二大品系，即占七十%市场的金黄色羽毛、黑嘴、黑脚的土鸡与占二十%、较小型的黑色或花色羽毛、黑嘴、黑脚的放山土鸡，另约十%的特殊土鸡，如斗鸡、阉鸡等，特别的是台湾土鸡的总量与白色肉鸡之比，高达五一比四九，占全世界第一位，然而台湾土鸡的市场交易方式以毛鸡买卖为主，屠体买卖为副，因此随产量与年节的需求变动，毛鸡价格变动幅度变大，加上种鸡场各据山头，资讯封闭，产销行情掌握在少数大盘手中，几无议价筹码，因此亏损总是占多数，赚钱的总是少数，形我产业发展的瓶颈，无怪乎产、官、学、研曾多次拟以土鸡战胜洋鸡的策略来规避加入 WTO 之後的冲击均无法成熟，为今之计较成熟的共识是推动土鸡电宰，并建立品牌，逐渐增加屠体买卖，降低传统市场毛鸡买卖的比率，给台湾土鸡在生鲜超市与白肉鸡公平竞争的机会，而以 CAS 土鸡认证，配合活泼主动的行销手段，希望能开拓土鸡市场的新天地。

由於土鸡的产值高於白肉鸡，而且饲养者以半开放式或放山式为主，自动化之可行性有限，因此协助土鸡业者建立小型地区性的土鸡电宰厂，仍成为必然，同时配合土鸡业者倡议组织区域性的毛鸡产销合作社或小型策略联盟，以建立毛鸡产销的新秩序，才能早日挽回土鸡业者正规经营的信心，同时对於缓和鸡肉进口的冲击具有正面的意义。

在此特别一提的是省畜产试验所与中兴大学所纯系化的台湾土鸡品系，肉质优美，体形适中，产蛋性能亦佳，唯独生产成本偏高，业者踌躇不前，在推广上遇到瓶颈，而在民间培育的金黄羽毛品系的鸡种虽体型优良，羽毛亮丽，早熟，换肉率佳，但因近亲繁殖与业者缺乏产蛋性能的育种技术，产蛋率逐渐下降，雏鸡成本逐年提高，同样也遇到瓶颈，若能促成产业界与学术界的结合，以民间的市场经验，配合专家学者的专家技术指导，则台湾土鸡的发展将无可限量。